我们公司也出现过类似情况，用南京仙林的无损分选仪分出来的。你可以在网上自己搜一下这个厂家，这台仪器不贵的。
而且产品表面内部都没有任何的损伤。
方案1、车两平面，淬油，45@是硬度很低的，35CrMo至少有HRC53吧，
2、正火为，吹风，从硬度来区来区别
3、作光谱分析
4、逐个作碳分析太慢了
前两种方案会比较好
最好就是用便携式合金成分分析仪(便携式光谱)， 一打就出来了，现在很多厂家都有的，借用一下，5秒钟一个。
工件还有加工余量的就用手提打磨机打火花。
用便携式合金成分分析仪(便携式光谱),不会对工件有大的损伤；如果热处理时淬火，淬火硬度也可以检查出来哈
tuisi-xingsan 发表于 2012-1-13 22:01 static/image/common/back.gif
火花鉴定的话，零件表面必然有残余痕迹，不好
不会有什么影响，打硬度不也需要打磨？况且工件还需要加工
这两种材料的火花有明显的不同
因此火花鉴别最经济实用而且可靠
给楼主一个很简单的办法参考：成本不高，效率也比光谱好，速度没有分选仪快但是准确度高，
不知首楼主工件外形如何，是否做简单的打磨就能做硬度测试，如果行的话建议先将混料工件同时入油淬火，通过计算相同淬油条件下其表面硬度45#约45HRC，35CrMo约51HRC，相差6HRC，用洛氏硬度机可以识别；
举例说明：我公司2009年一批15万M16*40mm（螺纹段只有20mm，后面一段为光杆）螺栓发现混料，20CrMoTi与40Cr，用科润淬火油网带淬火后150度回火，经无芯磨光杆区表面磨削0.10mm后进行硬度全检测试，（经过计算油淬两材料硬度为：20CrMoTi=40HRC 40Cr=53HRC）识别率较高，7天24小时开工逐个硬度机检测出700只混料产品，
那不是变形很大了。
不知道楼主所在的单位有没有条件使用看谱镜。在看谱镜下，35CrMo钢与45钢的差别，那是相当于白人与黑人的差别。这种仪器一台也就几千块钱而已，价格便宜，易学易用，几乎不择使用环境，又快又准，五秒钟一件毫不夸张，对零件几乎无损伤。
方法很多，但楼主单位不想花钱。要求也高！！
数量不多+你有很多时间的情况下，慢慢打硬度就是了；
数量多+你没有足够时间的情况下，用材料分选仪，当初我们单位50B跟50钢混料了，都就是用它来分选的。
一是用光谱法鉴别，另外一个方法用硬度法检测
加工余量还有多大啊，如果是锻后热处理状态的可以打打硬度，调质状态的也可以这样。精加工后就难办了
前工序是什么帮你想想法子
用硬度计打打硬度吧，前一段时间我们公司把45号钢和42CrMo 给混了，最后没办法挨个打硬度分开了:)
火花鉴别应在非工作面上（最后精磨去掉磨痕），既简单有快捷。
采用化学元素分析议测一下MO的成分
可以火花鉴别，也可以油冷却 硬度方法区分出来。45钢硬度低，高的就是35CRMO
火花鉴定的话，零件表面必然有残余痕迹。可以用光谱仪检测。